中華民國兒童癌症基金會於民國七十一年七月正式成立，源起於國科會於民國七十年所資助的一項國際研究：「兒童癌症對中國家庭之影響」。該研究揭示了癌症對兒童及其家庭所帶來的深遠影響，促使社會各界凝聚共識，期盼能建立專責組織，長期協助面對癌症挑戰的家庭。

在美國教授 Dr. Ida Martinson 的鼓勵下，結合台大醫護專家團隊的共同倡議——包括台大醫院小兒血液腫瘤學專家林國信教授、台大醫學院小兒科李鍾祥教授、台大護理學系主任余玉眉教授，以及陳月枝教授等人，並獲得熱心社會人士慷慨贊助，基金會應運而生。